一、全州国考地表水（托什干河沙里桂兰克和克孜河卡拉贝利）断面（点位）水质状况总体为优。Ⅰ～Ⅲ类优良水质断面（点位）比例为100.0%；无Ⅳ类轻度污染、Ⅴ类中度污染、劣Ⅴ类重度污染水质断面（点位）。

二、全州区考河流（托什干河哈拉布拉克和克孜河斯木哈纳）断面水质状况总体为优。Ⅰ～Ⅲ类优良水质断面比例为100.0%；无Ⅳ类轻度污染、Ⅴ类中度污染、劣Ⅴ类重度污染水质断面（点位）。

三、全州各县（市）城市集中式饮用水水源地分别为阿图什市水源地、阿克陶县水源地、阿合奇县水源地、乌恰县康苏水库地表水水源地，水质状况总体为优。Ⅰ～Ⅲ类达标水质水源地比例为100.0%；不达标水质水源地比例为0%。