贯彻落实国家、自治区、自治州医疗保险、生育保险、医疗救助等医疗保障制度;贯彻落实国家跨省异地就医及费用结算政策，贯彻执行疆内异地就医和费用结算政策;贯彻执行药品、医用耗材、医疗服务项目、医疗服务设施等医保目录、支付标准和调整工作;负责医疗保险、生育保险的参保登记、缴费基数调整、保费征缴、清欠等工作；负责财政、税务、银行等部门的医疗和生育保险保费征缴对帐等工作。负责办理参保人员、参保单位及医疗保险、生育保险的增减变化手续和个人权益记录单的寄发工作。医保关系转移接续工作；承担定点医药机构医疗保障费用审核、预付和结算工作。负责参保人医疗费用审核报销及门诊特殊慢性病、医疗救助对象身份的信息维护及费用补助发放。协助开展异地就医备案、有关费用审核结算和日常管理工作及转诊转院监督工作；协助开展阿合奇县医疗保障基金稽核工作及对协议医药机构医保基金使用稽核工作;负责阿合奇县定点医药机构服务监控工作。负责医保参保数据的监测工作,分析提取异常数据并对其进行稽核;协助局机关调查处理违反医疗保障法律法规投诉举报案件；承担阿合奇县管理的医保基金（资金）核算管理工作。负责医疗保障基金预算、决算，负责阿合奇县医疗保险基金待遇支付和会计核算以及基金财务管理工作；负责编制医疗保障基金（资金）财务报表。开展基金运行分析和基金预警以及医疗保障信息数据的采集、统计、分析等工作；负责网络信息系统及数据安全建设的规划；负责各科室网络信息系统相关硬件设备的管理和维护；负责维修、报废鉴定，确保内外网络系统的稳定运行及完整准确和安全；负责做好各科室网络用户使用权限审批并组织落实好信息保密制度；承担阿合奇县档案管理标准化、规范化、信息化建设。落实有关档案管理的政策、法规及各项规章制度，负责医疗保障业务资料建档、保管、借阅、备案。负责提供档案的查询服务；完成上级组织交办的其他任务。